SoTe kuntayhtymän ylintä päätösvaltaa käyttää yhtymävaltuusto.

Yhtymävaltuustossa on yhteensä 43 jäsentä, johon jäsenkunnat valitsevat jäsenkuntien valtuustojen toimikautta vastaavaksi ajaksi jäsenet ja heille henkilökohtaiset varajäsenet seuraavasti:

• Saarijärven kaupunki 21
• Karstulan kunta 10
• Kannonkosken kunta 4
• Kivijärven kunta 4
• Kyyjärven kunta 4

Valtuusto valitse toimikaudekseen keskuudestaan puheenjohtajan ja kaksi varapuheenjohtajaa.